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Worthington組織消化指南
引言
組織消化酶主要用于組織培養(yǎng)和細胞生物學研究的原代細胞的分離和收集。盡管這些消化酶已經(jīng)普遍應用多年，但是對其組織消化和細胞收集的作用機制卻沒有全面的理解。 由此導致的結果便是選擇一種消化方法大多是隨機選擇或基于過去的經(jīng)驗，而不是在*理解消化原理的基礎上選擇的消化方案，以及如何根據(jù)具體實驗目的修正消化方案以獲得更好的實驗結果。
細胞分離程序的目的是zui大程度的獲得功能活性的單個細胞，而影響結果的原因有很多，包括（不限于）以下：
1、組織類型
2、物種來源
3、動物年齡
4、遺傳改造情況（如knockouts）
5、所用的消化培養(yǎng)液
6、所用的酶
7、消化酶中的雜質(zhì)
8、所用消化酶的工作濃度
9、溫度
10、孵育時間
通常前四個原因沒辦法選擇，而剩下的原因一般由經(jīng)驗決定以獲取zui適實驗結果。
通過查閱文獻來選擇*組織消化酶和zui適消化條件的研究人員通常被互相矛盾的實驗數(shù)據(jù)搞得一頭霧水。這些巨大差異來源于組織胞外基質(zhì)的復雜而動態(tài)的特性，以及過去常用的粗制、未提純的組織分離酶。另外，組織胞外基質(zhì)由各種蛋白、糖蛋白、脂類和糖脂組成，這些成分的組成比例在不同物種、不同組織、甚至不同發(fā)育（年齡）之間存在明顯的差異，這些因素都極大的影響了消化方案的制定。目前通常使用的粗制酶，如鏈霉蛋白酶、NF1:250、以及含有幾種其他不同濃度蛋白酶的膠原酶、以及各種多糖酶、核酶和脂酶。
本指南總結了目前常用組織消化酶的zui適消化和細胞收集知識和方法，描述了標準的實驗步驟， 以便于制定一個*的細胞分離方案，同時列舉了一些相關的參考文獻。
下表列出多種組織的適宜消化酶（含參考文獻，以組織類型和物種分類，詳見鏈接）
脂肪組織 | 腎上腺組織 | 骨組織 | 腦組織 |
軟骨組織 | 結腸組織 | 內(nèi)皮組織 | 上皮組織 |
眼 | 心臟 | 腸 | 腎 |
肝 | 肺 | 淋巴結 | 乳腺 |
其它組織 | 其他組織 | 肌組織 | 神經(jīng)組織 |
胰腺 | 腮腺 | 垂體 | 前列腺 |
生殖 | 動物鱗片 | 皮膚 | 脾臟 |
干細胞 | 胸腺 | 甲狀腺/甲狀旁腺 | 扁桃體 |
腫瘤 |
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注：使用Worthington公司消化酶的文獻不限于上表鏈接中所列，一般而言，Worthington公司的組織消化酶可用于大多組織類型的消化。
脾臟組織消化手冊
| 物種 | 詳細來源 | 細胞名稱 | 消化用酶 | 培養(yǎng)基 | 參考文獻 |
| 小鼠 | 小鼠 | Splenic | Collagenase Type 2: 0.1% | PBS | Klebanoff, C., Spencer, S., Torabi-Parizi, P., Grainger, J., Roychoudhuri, R., Ji, Y., Sukumar, M., Muranski, P., Scott, C., Hall, J., Ferreyra, G., Leonardi, A., Borman, Z. et al.: Retinoic Acid Controls the Homeostasis of Pre-cDC-Derived Splenic and Intestinal Dendritic Cells., J Exp Med 210, 1961, 2013 |
| 小鼠 | 小鼠 | Splenocytes | Collagenase Type 2: 0.16% | PBS | Yi, T. and Cyster, J.: EBI2-Mediated Bridging Channel Positioning Supports Splenic Dendritic Cell Homeostasis and Particulate Antigen Capture.,Elife Vol. 2,, , e00757, 2013 |
| Deoxyribonuclease I: 0.002% | |||||
| 小鼠 | 小鼠 | Spleen, bone marrow endothelial | Collagenase Type 4: 0.3-1.0% | PBS | Shi, C., Jia, T., Mendez-Ferrer, S., Hohl, T., Serbina, N., Lipuma, L., Leiner, I., Li, M., Frenette, P. and Pamer, E.: Bone Marrow Mesenchymal Stem and Progenitor Cells Induce Monocyte Emigration in Response to Circulating Toll-Like Receptor Ligands., Immunity 34, 590, 2011 |
| Deoxyribonuclease I: 20 u/ml | |||||
| 小鼠 | 小鼠, 雌性, 6-8 week | Dendritic | Collagenase Type 4: 0.05% | RPMI 1640 | Abou Fakher, F., Rachinel, N., Klimczak, M., Louis, J. and Doyen, N.: TLR9-Dependent Activation of Dendritic Cells by DNA from Leishmania Major Favors Th1 Cell Development and the Resolution of Lesions., J Immunol 182, 1386, 2009 |
| 小鼠 | 小鼠 | Dendritic | Collagenase Type 1: 0.5% | HBSS | Flano, E., Jewell, N., Durbin, R. and Durbin, J.: Methods Used to Study Respiratory Virus Infection.,Curr Protoc Cell Biol Vol. Chapter 26,, , Unit 26.3, 2009 |
| 小鼠 | 小鼠 | Dentritic | Collagenase: 300 u/ml | RPMI 1640 | Abe, K., Nguyen, K., Fine, S., Mo, J., Shen, C., Shenouda, S., Corr, M., Jung, S., Lee, J., Eckmann, L. and Raz, E.: Conventional Dendritic Cells Regulate the Outcome of Colonic Inflammation Independently of T Cells., Proc Natl Acad Sci U S A 104, 17022, 2007 |
| Deoxyribonuclease I: 0.002% | |||||
| 小鼠 | 小鼠 | Splenic | Collagenase Type 2: 0.1% | RPMI | Mueller, S., Matloubian, M., Clemens, D, Sharpe, A., Freeman, G., Gangappa, S., Larsen, C. and Ahmed, R.: Viral Targeting of Fibroblastic Reticular Cells Contributes to Immunosuppression and Persistence During Chronic Infection., Proc Natl Acad Sci U S A 104, 15430, 2007 |
| Deoxyribonuclease I: 0.1% | |||||
| 小鼠 | 小鼠 | Splenic stromal | Collagenase Type 3: 100-400 u/ml | HBSS | Benedict Chris A, De Trez Carl, Schneider Kirsten, Ha Sukwon, Patterson Ginelle, Ware Carl F:Specific remodeling of splenic architecture by cytomegalovirus, PLoS Pathog 2, e16, 2006 |
| 小鼠 | 小鼠 | Leukocytes | Collagenase Type 4: 43 u/ml | RPMI 1640 | Siragam, V., Crow, A., Brinc, D., Song, S., Freedman, J. and Lazarus, A.: Intravenous Immunoglobulin Ameliorates ITP via Activating Fc Gamma Receptors on Dendritic Cells., Nat Med 12, 688, 2006 |
| 小鼠 | 小鼠, 4-6 周 | Dentritic | Collagenase Type 1: 0.1% | RPMI-1640 | McLellan AlexanderD, Kapp Michaela, Eggert Andreas, Linden Christian, Bommhardt Ursula, Br枚cker Eva-B, K盲mmerer Ulrike, K盲mpgen Eckhart: Anatomic location and T-cell stimulatory functions of mouse dendritic cell subsets defined by CD4 and CD8 expression, Blood 99, 2084-93, 2002 |
| Deoxyribonuclease I: 0.001% | |||||
| 小鼠 | 小鼠 | Dentritic | Collagenase Type 3: 0.1% | RPMI 1640 | Schiavoni, F, Mattei, F, Sestili, P, Borghi, P, Venditti, M, Morse, H, Belardelli, F, and Gabrieli, L:ICSBP is Essential for the Development of Mouse Type I Interferon-producing Cells and for the Generation and Activation of CD8a+ Dendritic Cells, J Exp Med 196, 1415, 2002 |
| Deoxyribonuclease I: 325 u/ml | |||||
| 小鼠 | 小鼠 | Dentritic | Collagenase: 100 u/ml | HBSS | Brasel K, De Smedt T, Smith JL, Maliszewski CR: Generation of murine dendritic cells from flt3-ligand-supplemented bone marrow cultures, Blood 96, 3029-39, 2000 |
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